Primera referencia de propiedad del Señorío. Su titular, Pedro Miguel Bértiz, es nombrado Merino de las Montañas -juez de amplia jurisdicción- por el rey Carlos III el Noble.

A Pedro Miguel sucedieron sus descendientes directos en la propiedad a través de generaciones: Miguel Pérez, Petri Sanz, Juan Peris, Alain y finalmente Martín de Bértiz, al final del siglo XVI. Durante todo este tiempo el «Señorío de Bértiz» es una finca privada lo que la mantiene al margen de una explotación intensa en contraste con su entorno más humanizado. Sólo al final se dió lugar una explotación más desordenada del bosque y el valle coincidiendo con una época de frecuentes cambios de propietario.

Don Pedro Ciga y su esposa Dª Dorotea Fernandez adquieren la finca y mandan reconstruir diversos elementos arquitectónicos y ornamentales: se reconstruye el antiguo palacio, se construye el puente de acceso actual y se da forma al Jardín, ampliando el antiguo Jardinzar, y dotándolo de fuentes, estanques, pérgolas y cenadores con claras influencias románticas y modernistas. También se construye la pista de acceso al monte Aizkolegi en cuya cima se levanta una segunda residencia hoy en desuso.
Pero además Don Pedro aplica a todo el señorío de una gestión con objetivos de recuperación del bosque, que se había perdido por zonas, y de conservación de la naturaleza propia del valle. Fruto de esta labor podemos en la actualidad disfrutar de uno de los hayedos más espetaculares de toda la Península.

Cumpliendo los deseos de D. Pedro Ciga y Dª Dorotea Fernández el Señorío de Bértiz es declarado Parque Natural por el Gobierno de Navarra a propuesta del Departamento de Agricultura, Ganadería y Montes. Éste Departamento fue el responsable de la gestión del Parque que actualmente recae en el Departamento de Medio Ambiente, Ordenación del Territorio y Vivienda.